Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAPZBP47756 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CAPZBP47756 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms