Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACADSBP45954 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms