Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LTBRP36941 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms