Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD10P28358 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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