Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms