Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMB5P28074 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms