Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLA-DMAP28067 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms