Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NFKBIAP25963 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NFKBIAP25963 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms