Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA4P25789 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms