Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MCM3P25205 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCM3P25205 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCM3P25205 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCM3P25205 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCM3P25205 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCM3P25205 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCM3P25205 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCM3P25205 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCM3P25205 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCM3P25205 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MCM3P25205 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MCM3P25205 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCM3P25205 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms