Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRZ1P23471 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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