Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA2P17301 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms