Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 RIMKLB-213ENST00000619374 1519 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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HOXB1P14653 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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HOXB1P14653 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXB1P14653 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB1P14653 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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HOXB1P14653 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB1P14653 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXB1P14653 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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HOXB1P14653 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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HOXB1P14653 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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