Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB3P14651 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms