Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DEFA4P12838 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms