Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC172P0C7W6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms