Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PKHD1P08F94 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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