Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HSP90AB1P08238 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 523.7 ms