Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZBED1O96006 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZBED1O96006 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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