Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms