Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TIMM17BO60830 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TIMM17BO60830 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms