Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXA3O43365 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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