Protein–RNA interactions for Protein: O00623

PEX12, Peroxisome assembly protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX12O00623 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX12O00623 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX12O00623 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX12O00623 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX12O00623 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX12O00623 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX12O00623 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX12O00623 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX12O00623 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX12O00623 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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PEX12O00623 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PEX12O00623 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PEX12O00623 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX12O00623 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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PEX12O00623 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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PEX12O00623 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX12O00623 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX12O00623 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX12O00623 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX12O00623 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PEX12O00623 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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