Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PIK3C2AO00443 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms