Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CROCC2H7BZ55 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CROCC2H7BZ55 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms