Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DIRC3C9JPN6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DIRC3C9JPN6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms