Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PRRT4C9JH25 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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