Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HMGB1P1B2RPK0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms