Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC27.55■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BIVM-ERCC5R4GMW8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms