Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNX10Q9Y5X0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms