Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USP20Q9Y2K6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms