Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CEP164Q9UPV0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP164Q9UPV0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms