Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.02■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FOXD3Q9UJU5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms