Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBE1Q9UJT0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBE1Q9UJT0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms