Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KDM5BQ9UGL1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM5BQ9UGL1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms