Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
LINC00474Q9P2X8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms