Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms