Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms