Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC180Q9P1Z9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC180Q9P1Z9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms