Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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