Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TIMMDC1Q9NPL8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms