Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMYD3Q9H7B4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMYD3Q9H7B4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms