Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
BPESC1Q9GZL8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms