Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BHLHE41Q9C0J9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms