Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CEP44Q9C0F1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CEP44Q9C0F1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms