Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMBRA1Q9C0C7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms