Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD66-202ENST00000565422 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf135-201ENST00000377197 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM30-201ENST00000397764 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX7A2L-204ENST00000463055 540 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104116.1-201ENST00000504539 411 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms