Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC4A5Q9BY07 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms