Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VN1R3Q9BXE9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VN1R3Q9BXE9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms