Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
JSRP1Q96MG2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms